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Bruker Daltonics
Bruker

The SERVA ICPL-Kit

for Quantitative Proteomics

 

Proteomes quantitative MS 분석에 있어서의 새로운 차원

  • 질량 분석기에 의한 단백질 정량을 위한 새로운 labeling 기술
  • 단백질과 펩타이드 수준에서의 labeling이 가능
  • 높은 proteme 범위와 높은 감도를 위한 단백질 분취와 호환됨
  • Isoform modified 단백질 검출과 호환됨
  • 자동화된 분석과 재현성 있는 정량 통계
  • amaZon™ 이온 트랩을 포함하는 모든 질량 분석기를 지원
  • PROTEINEER-LC 1.1 suit에서 완벽하게 수행됨

분취전에 labeling

성공적인 proteomocs 프로젝트는 높은 감도와 proteome 범위를 가지는 단백질 분취를 필요로 합니다.

새로운 ICPL™ 기술은 (ICPL= Isotope Coded Protein Labeling) 이를 지원합니다.  따라서 분취전에 단백질 labeling을 할 수 있으며, 이 결과 정량 비를 유지할 수 있습니다.

 

실험 과정

  • 다른 세포 상태에서의 cell lysis ICPL labeling

  • 두 시료의 조합

  • 단백질 수준에서의 복잡성의 선택적인 감소. (예를 들면 2D GE, PAGE, LC 혹은 CLINPROT 마크네틱 비즈등에 의해서)

  • Fractionation과 연결하여 사용하는 전략이 가능합니다

  • 단백질 효소에 의한 소화

  • LC에 의한 펩타이트 수준에서의 복잡성의 선택적 감소

  • 질량 분석기(Quantitation, Identification) PROTEINEER-LC에서의 자동화된 통계적 분석

 

강력한 ICPL protein quantitation label 기술이 4가지 labels과 함께 제공됩니다:  Serva ICPLTM Quadruplex PLUS (ICPL-4plex Kit)!

시스템은  stable isotope protein labeling에 의한 4 가지의 독립적인 proteome 시료의 동시 정량이 가능합니다. ICPL- 기술은 intact protein fractionation 단계의 결합에 의해서  단백질의 확인과 정량을 넓은 동적 영역에서 제공합니다. 

Proteomes의 정량적인 MS 분석

여타의 labelling 기술과 비교하여, ICPL-4plex Kit는 ESI-MS나 MALDI-MS를 기반으로 하는 LC-MS와 SDS-PAGE protein molecular seizing을 결합한 GeLC 혹은 2D gel을 이용한 Top-Down proteome 분석이 가능합니다.   LC, PAGE, 2D-GE 혹은 magnetic beads를 활용한 실제적인 proteomics 스케일의 pre-fractionation이 가능합니다.  어떤 분취 단계에서도 일정한 양을 정량 비율로 남겨 놓는 ICPL- 기술은 단백질 분취에 적합합니다.  각각의 단백질 분취 단계에서 남겨진 물질의 복잡성은 결과적으로 단백질 검출과 정량의 동적 영역을 증가 시키고, 결과적으로 확인되는 단백질의 숫자를 증가 시킵니다.  labelled 펩타이드의 높은 sequence coverage는 과다한 수작업을 필요로 하는 밸리데이션을 필요로 하지 않고, 자동화된 단백질 정량을 할 수 있도록 합니다. 

ProteinScape와 통합

ICPL  기술은 ProteinScape, 브루커의 bioinformatics platform인 ProteinScape와 완전히 통합됩니다.  ProteinScape는 모든 형태의 proteomics 프로젝트를 보관, 관리하고 HUPO/PSI publication guidelines에 따라 결과를 출력합니다.

ICPL kit의 특징  

  • Glu-C+Trypsin double digestion에 의해 향상된 sequence coverage
  • Labelled와 digested 펩타이드 표준품이 포함되어 있음
  • 4개의 proteomes까지 비교 분석
  • PTMs과 isoforms의 분석 
  • ProteinScape 2와 완전히 일체화 됨

Kit

ICPL-kit는 다음과 같은 두 가지 구성이 가능합니다:

 

 

Learn more about ICPL labeling strategies:

Leitet Herunterladen der Datei einIsotope-Coded Protein Labeling (ICPL) for Quantitative Proteomics Workflows Compatible with Protein Separation Strategies. Application Note MT-106

Leitet Herunterladen der Datei einICPL Labeling in Functional Proteomics Experiments: Substrate Identification of the Extracellular Protease ADAMTS1 using SDS-PAGE LC-MS/MS. Application Note LCMS-56

Öffnet externen Link in neuem FensterICPL: A new quantitative mass spectrometric method for proteomics. Application Note MT-78

Öffnet externen Link in neuem FensterAccurate Quantification with ICPL: The Quantification Study of the ABRF Proteomics Research Group 2006. Application Note MT-83

 

 

The SERVA ICPL-Kit was

invented by Schmidt, Lottspeich & Kellermann (Öffnet einen externen Link in einem neuen FensterProteomics 2005, 1, 4–15),

developed by Öffnet einen externen Link in einem neuen FensterTopLab, Munich,

is produced by Öffnet einen externen Link in einem neuen FensterSERVA Electrophoresis Heidelberg

and available through Öffnet einen internen Link im aktuellen FensterBruker Daltonics CARE online.

 

 

 
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